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En el Herbario todos los especímenes, una vez montados, etiquetados y numerados, con o sin clasificación taxonómica deben ser registrados en una base de datos (BD) computarizada. El manejo de información taxonómica y de las colecciones científicas tiene que efectuarse por medio de una base de datos electrónica, por el momento estamos en un proceso construcción de la misma y los datos se manejan en diferentes programas como ser Excel, Access, Trópicos y Brams. Sin embargo contamos con una base de datos concatenadas de estas fuentes que suman 64000 registros o especímenes.
La base de datos es un sistema de mantenimiento de registros basados en computadoras, es decir un sistema cuyo propósito general es registrar y mantener información. La misma que se constituye en una herramienta para los botánicos, no solamente facilita la investigación y el poder compartir información solicitada, sino puede incrementar considerablemente la eficiencia de operaciones básicas en los herbarios, tales como la generación de etiquetas de especímenes, etiquetas de determinación, lista de identificación, cálculos estadísticos, generación de catálogos de especímenes y finalmente una rápida búsqueda acerca de especímenes del herbario.
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