La colección científica consta de aproximadamente 100000 especímenes, además existen más de 50000 especímenes en procesamiento, la colección incluye plantas vasculares (incluyendo helechos), musgos, hongos y líquenes. Asimismo el herbario posee colecciones Tipo, es decir a nivel de especie y para fines de nomenclatura, el nombre de cada taxón específico se basa en un único y particular ejemplar de herbario (el tipo), al cual se asocia de manera permanente, designado para documentar a una designación en particular, independiente de su status futuro.
